DNA鏈置換反應(yīng)是一種利用DNA分子雜交自由能的差異來將一條單鏈序列取代另一條單鏈序列的方法。這種方法具有精確的序列正交性,因此非??煽恳子诓僮?。 當(dāng)DNA分子發(fā)生雙鏈斷裂后,末端會形成31單鏈突出。這段單鏈可以被RecA蛋白纏繞成螺旋絲狀結(jié)構(gòu),也稱為核蛋白絲。這個核蛋白絲會穿過雙鏈DNA,在其中搜尋與之同源的序列,并發(fā)生鏈交換。在核蛋白絲中的入侵鏈(I鏈)替換與之同源的雙鏈DNA中的被替換鏈(O鏈),與其互補(bǔ)的鏈(C鏈)結(jié)合形成新的雙鏈。這個過程類似于拼插,使得原本受損的DNA分子得到了修復(fù)和復(fù)制。